Báňovice (Moravia),
Bednárec (Bohemia),
Bednáreček (Bohemia),
Blažejov (Blažejov, Dvoreček, Malý Ratmírov, Mutyněves, Oldřiš) (Bohemia); Blažejov (Bohemia), Dvoreček (Bohemia), Malý Ratmírov (Bohemia), Mutyněves (Bohemia), Oldřiš (Bohemia),
Bořetín (Bohemia),
Březina (Bohemia),
Budeč (Borová, Budeč) (Moravia); Borová (Moravia), Budeč (Moravia),
Budíškovice (Budíškovice, Manešovice, Ostojkovice, Vesce) (Moravia); Budíškovice (Moravia), Manešovice (Moravia), Ostojkovice (Moravia), Vesce (Moravia),
Cep (Bohemia),
Cizkrajov (Cizkrajov, Dolní Bolíkov, Holešice, Mutná) (Moravia); Cizkrajov (Moravia), Dolní Bolíkov (Moravia), Holešice (Moravia), Mutná (Moravia),
Červený Hrádek (Moravia),
České Velenice (Bohemia),
Český Rudolec (Český Rudolec, Horní Radíkov, Lipnice, Markvarec, Matějovec, Nová Ves, Nový Svět, Radíkov, Rožnov, Stoječín) (Moravia); Český Rudolec (Moravia), Horní Radíkov (Moravia), Lipnice (Moravia), Markvarec (Moravia), Matějovec (Moravia), Nová Ves (Moravia), Nový Svět (Moravia), Radíkov (Moravia), Rožnov (Moravia), Stoječín (Moravia),
Číměř (Bílá, Číměř, Dobrá Voda, Lhota, Nová Ves, Potočná, Sedlo) (Bohemia); Bílá (Bohemia), Číměř (Bohemia), Dobrá Voda (Bohemia), Lhota (Bohemia), Nová Ves (Bohemia), Potočná (Bohemia), Sedlo (Bohemia),
Člunek (Člunek, Kunějov, Lomy) (Bohemia); Člunek (Bohemia), Kunějov (Bohemia), Lomy (Bohemia),
Dačice (Bílkov, Borek, Dačice I, Dačice II, Dačice III, Dačice IV, Dačice V, Dolní Němčice, Hostkovice, Hradišťko, Chlumec, Lipolec, Malý Pěčín, Prostřední Vydří, Toužín, Velký Pěčín) (Moravia); Bílkov (Moravia), Borek (Moravia), Dačice I (Moravia), Dačice II (Moravia), Dačice III (Moravia), Dačice IV (Moravia), Dačice V (Moravia), Dolní Němčice (Moravia), Hostkovice (Moravia), Hradišťko (Moravia), Chlumec (Moravia), Lipolec (Moravia), Malý Pěčín (Moravia), Prostřední Vydří (Moravia), Toužín (Moravia), Velký Pěčín (Moravia),
Dešná (Bělčovice, Dančovice, Dešná, Hluboká, Chvalkovice, Plačovice, Rancířov) (Moravia); Bělčovice (Moravia), Dančovice (Moravia), Dešná (Moravia), Hluboká (Moravia), Chvalkovice (Moravia), Plačovice (Moravia), Rancířov (Moravia),
Deštná (Deštná, Lipovka) (Bohemia); Deštná (Bohemia), Lipovka (Bohemia),
Dívčí Kopy (Bohemia),
Dobrohošť (Moravia),
Dolní Pěna (Bohemia),
Dolní Žďár (Dolní Žďár, Horní Lhota) (Bohemia); Dolní Žďár (Bohemia), Horní Lhota (Bohemia),
Domanín (Bohemia),
Doňov (Bohemia),
Drunče (Annovice, Drunče) (Bohemia); Annovice (Bohemia), Drunče (Bohemia),
Dunajovice (Bohemia),
Dvory nad Lužnicí (Bohemia), do roku 1920 Dolní Rakousko
Frahelž (Bohemia),
Hadravova Rosička (Bohemia),
Halámky (Bohemia), do roku 1920 Dolní Rakousko
Hamr (Bohemia),
Hatín (Hatín, Jemčina, Stajka) (Bohemia); Hatín (Bohemia), Jemčina (Bohemia), Stajka (Bohemia),
Heřmaneč (Moravia),
Horní Meziříčko (Moravia),
Horní Němčice (Moravia),
Horní Pěna (Horní Pěna, Malíkov nad Nežárkou) (Bohemia); Horní Pěna (Bohemia), Malíkov nad Nežárkou (Bohemia),
Horní Radouň (Bukovka, Horní Radouň, Nový Bozděchov, Starý Bozděchov) (Bohemia); Bukovka (Bohemia), Horní Radouň (Bohemia), Nový Bozděchov (Bohemia), Starý Bozděchov (Bohemia),
Horní Skrýchov (Bohemia),
Horní Slatina (Moravia),
Hospříz (Hospříz, Hrutkov) (Bohemia); Hospříz (Bohemia), Hrutkov (Bohemia),
Hrachoviště (Bohemia),
Hříšice (Hříšice, Jersice) (Moravia); Hříšice (Moravia), Jersice (Moravia),
Chlum u Třeboně (Chlum u Třeboně, Lutová, Mirochov, Žíteč) (Bohemia); Chlum u Třeboně (Bohemia), Lutová (Bohemia), Mirochov (Bohemia), Žíteč (Bohemia),
Jarošov nad Nežárkou (Hostějeves, Jarošov nad Nežárkou, Kruplov, Lovětín, Matějovec, Nekrasín, Pejdlova Rosička, Zdešov) (Bohemia); Hostějeves (Bohemia), Jarošov nad Nežárkou (Bohemia), Kruplov (Bohemia), Lovětín (Bohemia), Matějovec (Bohemia), Nekrasín (Bohemia), Pejdlova Rosička (Bohemia), Zdešov (Bohemia),
Jilem (Moravia),
Jindřichův Hradec (Buk, Děbolín, Dolní Radouň, Dolní Skrýchov, Horní Žďár, Jindřichův Hradec I, Jindřichův Hradec II, Jindřichův Hradec III, Jindřichův Hradec IV, Jindřichův Hradec V, Matná, Otín, Políkno, Radouňka) (Bohemia); Buk (Bohemia), Děbolín (Bohemia), Dolní Radouň (Bohemia), Dolní Skrýchov (Bohemia), Horní Žďár (Bohemia), Jindřichův Hradec I (Bohemia), Jindřichův Hradec II (Bohemia), Jindřichův Hradec III (Bohemia), Jindřichův Hradec IV (Bohemia), Jindřichův Hradec V (Bohemia), Matná (Bohemia), Otín (Bohemia), Políkno (Bohemia), Radouňka (Bohemia),
Kačlehy (Bohemia),
Kamenný Malíkov (Bohemia),
Kardašova Řečice (Kardašova Řečice, Mnich, Nítovice) (Bohemia); Kardašova Řečice (Bohemia), Mnich (Bohemia), Nítovice (Bohemia),
Klec (Bohemia),
Kostelní Radouň (Bohemia),
Kostelní Vydří (Bohemia),
Kunžak (Kaproun, Kunžak, Mosty, Suchdol, Terezín, Valtínov, Zvůle) (Bohemia, Moravia); Kaproun (Bohemia), Kunžak (Bohemia), Mosty (Bohemia), Suchdol (Bohemia), Terezín (Bohemia), Valtínov (Moravia), Zvůle (Bohemia),
Lásenice (Bohemia),
Lodhéřov (Lodhéřov, Najdek, Studnice) (Bohemia); Lodhéřov (Bohemia), Najdek (Bohemia), Studnice (Bohemia),
Lomnice nad Lužnicí (Bohemia),
Lužnice (Bohemia),
Majdalena (Bohemia),
Nová Bystřice (Albeř, Artolec, Blato, Hradiště, Hůrky, Klášter, Klenová, Nová Bystřice, Nový Vojířov, Ovčárna, Senotín, Skalka, Smrčná) (Bohemia); Albeř (Bohemia), Artolec (Bohemia), Blato (Bohemia), Hradiště (Bohemia), Hůrky (Bohemia), Klášter (Bohemia), Klenová (Bohemia), Nová Bystřice (Bohemia), Nový Vojířov (Bohemia), Ovčárna (Bohemia), Senotín (Bohemia), Skalka (Bohemia), Smrčná (Bohemia),
Nová Olešná (Bohemia),
Nová Včelnice (Bohemia),
Nová Ves nad Lužnicí (Nová Ves nad Lužnicí, Žofina Huť) (Bohemia); Nová Ves nad Lužnicí (Bohemia), Žofina Huť (Bohemia), do roku 1920 Dolní Rakousko
Novosedly nad Nežárkou (Kolence, Mláka, Novosedly nad Nežárkou) (Bohemia); Kolence (Bohemia), Mláka (Bohemia), Novosedly nad Nežárkou (Bohemia),
Okrouhlá Radouň (Bohemia),
Peč (Lidéřovice, Peč, Urbaneč) (Moravia); Lidéřovice (Moravia), Peč (Moravia), Urbaneč (Moravia),
Písečné (Chvaletín, Marketa, Modletice, Nové Sady, Písečné, Slavětín, Václavov) (Moravia); Chvaletín (Moravia), Marketa (Moravia), Modletice (Moravia), Nové Sady (Moravia), Písečné (Moravia), Slavětín (Moravia), Václavov (Moravia),
Pístina (Bohemia),
Plavsko (Bohemia),
Pleše (Bohemia),
Pluhův Žďár (Červená Lhota, Jižná, Klenov, Mostečný, Plasná, Pluhův Žďár, Pohoří, Samosoly) (Bohemia); Červená Lhota (Bohemia), Jižná (Bohemia), Klenov (Bohemia), Mostečný (Bohemia), Plasná (Bohemia), Pluhův Žďár (Bohemia), Pohoří (Bohemia), Samosoly (Bohemia),
Polště (Bohemia),
Ponědraž (Bohemia),
Ponědrážka (Bohemia),
Popelín (Horní Olešná, Popelín) (Bohemia, Moravia); Horní Olešná (Moravia), Popelín (Bohemia, Moravia),
Příbraz (Bohemia),
Rapšach (Nová Ves u Klikova, Rapšach) (Bohemia); Nová Ves u Klikova (Bohemia), Rapšach (Bohemia), část území obce náležela do roku 1920 k Dolním Rakousům
Ratiboř (Bohemia),
Rodvínov (Jindřiš, Rodvínov) (Bohemia); Jindřiš (Bohemia), Rodvínov (Bohemia),
Roseč (Bohemia),
Rosička (Bohemia),
Slavonice (Kadolec, Maříž, Mutišov, Rubašov, Slavonice, Stálkov, Vlastkovec) (Moravia); Kadolec (Moravia), Maříž (Moravia), Mutišov (Moravia), Rubašov (Moravia), Slavonice (Moravia), Stálkov (Moravia), Vlastkovec (Moravia),
Smržov (Bohemia),
Staňkov (Bohemia),
Staré Hobzí (Janov, Nové Dvory, Nové Hobzí, Staré Hobzí, Vnorovice) (Moravia); Janov (Moravia), Nové Dvory (Moravia), Nové Hobzí (Moravia), Staré Hobzí (Moravia), Vnorovice (Moravia),
Staré Město pod Landštejnem (Dobrotín, Landštejn, Návary, Podlesí, Pomezí, Staré Město pod Landštejnem, Veclov, Vitíněves) (Bohemia); Dobrotín (Bohemia), Landštejn (Bohemia), Návary (Bohemia), Podlesí (Bohemia), Pomezí (Bohemia), Staré Město pod Landštejnem (Bohemia), Veclov (Bohemia), Vitíněves (Bohemia),
Stráž nad Nežárkou (Dolní Lhota, Dvorce, Stráž nad Nežárkou) (Bohemia); Dolní Lhota (Bohemia), Dvorce (Bohemia), Stráž nad Nežárkou (Bohemia),
Strmilov (Česká Olešná, Leština, Malý Jeníkov, Palupín, Strmilov) (Bohemia, Moravia); Česká Olešná (Moravia), Leština (Bohemia), Malý Jeníkov (Moravia), Palupín (Moravia), Strmilov (Bohemia),
Stříbřec (Libořezy, Mníšek, Stříbřec) (Bohemia); Libořezy (Bohemia), Mníšek (Bohemia), Stříbřec (Bohemia),
Střížovice (Budkov, Střížovice, Vlčice) (Bohemia); Budkov (Bohemia), Střížovice (Bohemia), Vlčice (Bohemia),
Studená (Domašín, Horní Bolíkov, Horní Pole, Maršov, Olšany, Skrýchov, Studená, Sumrakov, Světlá, Velký Jeníkov) (Bohemia, Moravia); Domašín (Bohemia, Moravia), Horní Bolíkov (Moravia), Horní Pole (Moravia), Maršov (Moravia), Olšany (Moravia), Skrýchov (Moravia), Studená (Moravia), Sumrakov (Moravia), Světlá (Moravia), Velký Jeníkov (Moravia),
Suchdol nad Lužnicí (Bor, Františkov, Hrdlořezy, Klikov, Suchdol nad Lužnicí, Tušť) (Bohemia); Bor (Bohemia), Františkov (Bohemia), Hrdlořezy (Bohemia), Klikov (Bohemia), Suchdol nad Lužnicí (Bohemia), Tušť (Bohemia), část území obce náležela do roku 1920 k Dolním Rakousům
Světce (Bohemia),
Třebětice (Moravia),
Třeboň (Branná, Břilice, Holičky, Nová Hlína, Přeseka, Stará Hlína, Třeboň I, Třeboň II) (Bohemia); Branná (Bohemia), Břilice (Bohemia), Holičky (Bohemia), Nová Hlína (Bohemia), Přeseka (Bohemia), Stará Hlína (Bohemia), Třeboň I (Bohemia), Třeboň II (Bohemia),
Újezdec (Bohemia),
Velký Ratmírov (Bohemia),
Vícemil (Bohemia),
Višňová (Bohemia),
Vlčetínec (Bohemia),
Volfířov (Brandlín, Lipová, Poldovka, Radlice, Řečice, Šach, Velká Lhota, Volfířov) (Moravia); Brandlín (Moravia), Lipová (Moravia), Poldovka (Moravia), Radlice (Moravia), Řečice (Moravia), Šach (Moravia), Velká Lhota (Moravia), Volfířov (Moravia),
Vydří (Bohemia),
Záblatí (Bohemia),
Záhoří (Bohemia),
Zahrádky (Horní Dvorce, Zahrádky) (Bohemia, Moravia); Horní Dvorce (Bohemia, Moravia), Zahrádky (Bohemia, Moravia),
Žďár (Malá Rosička, Žďár) (Bohemia); Malá Rosička (Bohemia), Žďár (Bohemia),
Županovice (Moravia)