V Kraji Vysočina se nacházejí celkem dvě vysoké školy:
Vysoká škola polytechnická Jihlava byla zřízena zákonem (č. 375/2004 Sb. ze dne 3. 6. 2004) jako první veřejná vysoká škola neuniverzitního směru.
Západomoravská vysoká škola Třebíč – nejstarší vysoká škola v Kraji Vysočina