Povodí Balinky
Balinka, Naučná stezka Balinské údolí, Pohořílský potok, Rychtářský rybník,
Povodí Bečvy
Bečva, Vsetínská Bečva, Balaton (Nový Hrozenkov), Černý potok (přítok Jezernice), Dolní Mlýny (Podhoří), Evropské rozvodí Bělotín, Hranické jezírko, Choryňský mokřad, Jezernice (potok), Juhyně, Klauza v Rajnochovicích, Křištálová studánka, Kudlačena, Loučská kaskáda, Malé laguny, Nádrž Tesák, Paláčkův mlýn, Partutovický vodopád, Pramen Juřacka, Rákosina ve Stříteži nad Bečvou, Rožnovská Bečva, Srnkov (přítok Jezernice), Škrabalka, Šlosarova studánka, Těšice (přírodní památka), Trnávka (přítok Bečvy), Velička (přítok Bečvy), Vodní nádrž Horní Bečva, Vodopád U Rybářů, Žabnický vodopád, Žabník (potok), Žebračka,
Povodí Bělé
Bělá (přítok Svitavy), Horní Bělá (přírodní památka), Lebeďák, Pavlovské mokřady, Pilské údolí, Pod Švancarkou, Pohorská louka, Uhliska (přírodní rezervace), V chaloupkách, Vodní nádrž Boskovice,
Povodí Bílého potoka
Bílý potok (pravý přítok Svratky), Bítýška, Přírodní park Údolí Bílého potoka, Tvrzský rybník,
Povodí Blaty
Blata (řeka), Hrdibořické rybníky, Malý Kosíř, Terezské údolí, Tučapská skalka, Vápenice (přírodní památka),
Povodí Bobravy
Bobrava, Augšperský potok (přírodní památka), Bílá voda (přítok Bobravy), Kamenný most (Rosice), Klapalův mlýn, Přírodní park Bobrava, Říčanský potok (přítok Bobravy), Střelická bažinka, Zhořská mokřina, Železniční viadukt u Střelic,
Povodí Branné
Branná (přítok Moravy), Františkov (přírodní rezervace), Mlýn v Ostružné, Niva Branné, Pod Slunečnou strání, Vodní mlýn v Branné,
Povodí Brtnice
Brtnice (řeka), Čimbordy, Na podlesích, Opatovské zákopy, U Římské studánky, Údolí Brtnice,
Povodí Desné
Desná (přítok Moravy), Borový vodopád, Dlouhé stráně (dolní nádrž), Dlouhé stráně (horní nádrž), Merta (řeka), Přečerpávací vodní elektrárna Dlouhé stráně, Vřesová studánka,
Povodí Dřevnice
Dřevnice, Bezedník, Bukové hory, Bzová (přírodní památka), Fryštácký potok, Holíkova rezervace, Jalovcová louka, Králky, Pernikářská, Pod Drdolem, Pod Obecním kopcem, Přehrada Fryšták, Skály (přírodní památka), Solisko (přírodní památka), Vela,
Povodí Dyje
Dyje, Povodí Dyje, Jevišovka (řeka), Jihlava (řeka), Kyjovka, Moravská Dyje, Rakouská Dyje, Svratka, Trkmanka, Želetavka, Allahovy rybníky, Andělský mlýn, Betlém (přírodní památka), Cahnov – Soutok, Červený rybníček, Daníž, Dyjsko-mlýnský náhon, Dyjský trojúhelník, Františkův rybník, Gránický potok, Hevlínské jezero, Jaroslavický rybník, Jezero (přírodní památka), Jezírko Kutnar, Kanál Krhovice – Hevlín, Křivé jezero, Květné jezero, Květné jezero (přírodní památka), Lednické rybníky, Mahenovo jezero, Mušlovský dolní rybník, Mušlovský horní rybník, Naučná stezka Věstonická nádrž, Nový rybník (Mikulov), Obora Soutok, Pastvisko u Lednice, Povodí Svratky, Přírodní park Niva Dyje, Pulkava (řeka), Rybniční potok (přítok Včelínku), Stříbrné vodopády, Štinkovka, Tasovický mlýn, Tichý ostrov, Uherčická louka, Včelínek, Věstonická nádrž (přírodní rezervace), Zámecká Dyje,
Povodí Fryšávky
Fryšávka, Medlov (rybník), Podmedlovský mlýn, Prosička, Štarkov,
Povodí Hané
Haná (řeka), Brodečka, Drnůvka, Fricův mlýn, Křéby, Malá Haná (řeka), Medlovický potok, Nad Medlovickým potokem, Pahorek (přírodní památka), Roznitál, Studnické louky, Údolí Velké Hané, Velká Haná (řeka), Vitčický les, Vodní nádrž Opatovice, Zouvalka (přírodní rezervace),
Povodí Hloučely
Biokoridor Hloučela, Bukový potok (přítok Zábrany), Ohrozim-Horka, Prameniště Hamerského potoka U velké jedle, Protivanov (přírodní památka), Rašeliniště v Klozovci, Repešský potok, Zábrana,
Povodí Hodonínky
Hodonínka, Crhovský mlýn, Cukl a Rozsečské rašeliniště, Čepičkův vrch a údolí Hodonínky, Loucká obora, Nad Berankou, Nyklovický potok,
Povodí Jevišovky
Jevišovka (řeka), Ctidružický potok, Domčický mlýn, Habrová seč, Hammrschmiedův mlýn, Hraběcí studánka, Karlov (přírodní rezervace), Křepička (potok), Lapikus, Mikulovické jezero, Nedveka, Oleksovická mokřina, Oleksovické vřesoviště, Plenkovický potok, Pod Šibeničním kopcem, Přírodní park Jevišovka, Radkovský mlýn (Hostim), Rudlické kopce, Skalička (potok), Stříbrný vrch (přírodní památka, okres Znojmo), U kapličky, U lusthausu, Únanovka, Vodní mlýn v Hlubokých Mašůvkách, Vodní nádrž Výrovice, Žleby (přírodní památka),
Povodí Jičínky
Jičínka, Králův potok, Papakův potok, Zrzávka,
Povodí Jihlavy
Jihlava (řeka), Brtnice (řeka), Jihlávka (řeka), Oslava, Rokytná (řeka), Třešťský potok, Borovinský most, Borovinský rybník, Čermákovy louky, Černý rybník (Smrčná), Dolní mlýn (Větrný Jeníkov), Dolní mušovský luh, Dukovanský mlýn, Hojkovské rašeliniště, Hraniční potok (přítok Jihlavy), Chvojnov (přírodní rezervace), Jistebník (rybník), Jordán (Třebíč), K pramenům Počátek, Klapovský potok, Kratochvílův mlýn, Kuchyňka (Třebíč), Lubí, Miroslavka, Mlýnský náhon (řeka Jihlava), Mohelnička (přítok Jihlavy), Mohelský mlýn, Na Oklice, Nad Svitákem, Novoveský rybník, Nový rybník (přírodní rezervace, okres Pelhřimov), Olbramovický potok, Pohořelické rybníky, Přečerpávací vodní elektrárna Dalešice, Přírodní park Niva Jihlavy, Ptáčovské rybníky, Rybník Starý, Starý rybník (Pohořelice), Stařečský potok, Šatava, Šilhánky, Šimanovské rašeliniště, Šumický rybník, Troskotovický dolní rybník, Týnský potok, U Miličovska, U potoků, Vílanecké rašeliniště, Vodní elektrárna Mohelno, Vodní mlýn (Hrubšice), Vodní mlýn v Okříškách, Vodní nádrž Dalešice, Vodní nádrž Hubenov, Vodní nádrž Kožichovice, Vodní nádrž Lubí, Vodní nádrž Mohelno, Vodní šindelna, Vrkoč (rybník),
Povodí Jihlávky
Jihlávka (řeka), Čížovský potok, Lužný rybník, Panský mlýn (Rančířov), Pístovské mokřady, Rašeliniště Loučky, Rybníky V Pouštích, Stará plovárna (Jihlava),
Povodí Krupé
Krupá (přítok Moravy), Chrastický hadec, Chrastický potok, Prudký potok (přítok Krupé), Stříbrnický potok (přítok Krupé), Štěpánovský potok (přítok Krupé), Zrcadlový potok (přítok Krupé),
Povodí Křetínky
Křetínka, Jedlovské rybníky (okres Svitavy), Panský rybník (Bystré), Rohozenský potok (přítok Křetínky), Rybník Rebeka, Skalní rybník (Jedlová), Stašovské rybníky, Vodní nádrž Letovice,
Povodí Křtinského potoka
Křtinský potok, Jedovnický potok, Strhovec, Studánka Liščí leč, Studánka Nad Křtinami, Zemanův žleb,
Povodí Kyjovky
Hruškovice (potok), Kyjovka, Hodonínské rybníky, Jarohněvický rybník, Mutěnické rybníky, Písečný rybník, Prušánka, Stará Hráz, Svodnice (přítok Kyjovky), U srubu, Vodní nádrž Koryčany,
Povodí Litavy
Litava (přítok Svratky), Baračka, Blučiňák, Dunávka, Hostěnické propadání, Hranečnický potok, Hrubá louka, Kuče, Mariánské údolí (Brno), Přírodní park Rakovecké údolí, Přírodní park Říčky, Rakovec (přítok Litavy), Roketnice, Říčka (přítok Litavy), Strabišov-Oulehla, Šaratica, Šévy, U Staré Vápenice, Údolí Říčky, Ve žlebcách, Velký Hornek, Žabárník,
Povodí Loučky
Loučka (přítok Svratky), Bobrůvka (řeka), Buchalův vodní mlýn, Halda (potok), Libochovka (řeka), Most Míru (Dolní Loučky), Mostek v Dolní Libochové, Pernovka, Vodní mlýn v Petrovicích (Nové Město na Moravě), Železniční viadukt v Mezihoří,
Povodí Lubiny
Lubina (řeka), Jasníkova studánka, Kopřivnička, Lávka přes Lubinu (Příbor), Lomná (přítok Lubiny), Lubinka (přítok Lubiny), Sýkoreček, Tichávka, Vodní nádrž Větřkovice,
Povodí Moravy
Morava (řeka), Povodí Moravy, Povodí Moravy (státní podnik), Blata (řeka), Branná (přítok Moravy), Březnice (řeka), Desná (přítok Moravy), Dřevnice, Haná (řeka), Krupá (přítok Moravy), Oskava (řeka), Radějovka, Třebůvka, Romže, Valová, Velička (přítok Moravy), Bašnov, Baťův kanál, Bázlerova pískovna (jezero), Bezedné, Borinský kanál, Búdkoviansky potok, Buková (vodní nádrž), Cahnov – Soutok, Citovský mlýn, Častava, Černovírská kyselka, Čertov jarok, Devínské jezero, Dlouhá řeka, Dorfgrund Mühle, Dyjský trojúhelník, Evropské rozvodí Bělotín, Hluboček (přítok Bystřice), Hluboký potok (přítok Moravy), Hrudky (potok), Chomoutovské jezero, Chráněná krajinná oblast Litovelské Pomoraví, Chropyňský rybník, Chvojnica (přítok Moravy), Jakubský mlýn v Olomouci, Kalábová, Kamenitý potok (přítok Moravy), Kamenný most (Moravská Třebová), Kanada (přírodní rezervace), Kopřivák (potok), Kostolnica (vodní nádrž), Kotojedka, Kuchynská Malina, Kurfürstovo rameno, Kyjanka (přítok Říky), Lakšárský potok, Lázeňský mokřad, Libosvárka, Lichnička, Loučka (přítok Morávky), Malá Morava (potok), Malá Voda, Malá vodní elektrárna Spytihněv, Malina (řeka), Mírovka, Mlýnský náhon (Bolelouc), Mlýnský náhon (řeka Morava), Mlýnský potok (přítok Moravy), Močiarka (přítok Maliny), Mohelnické jezero, Mokřad Pumpák, Mokřiny u Krahulčí, Moravičanské jezero, Morávka (rameno Moravy), Moštěnka, Na letišti, Nečíz, Nepřívazský potok, Nepřívazský vodopád, Obora Soutok, Okluky, Olomoucký rybník, Ondrášovka, Orlovský kanál, Oskovec II, Panenský les, Panské louky, Pasecký vodopád, Pernecká Malina, Petříkovec, Pod Zápovědským kopcem, Poniklec, Porec, Posluchovské vodopády, Pramen Táborského a Ondrúškův, Průžkův mlýn, Přírodní park Mikulčický luh, Přírodní park Strážnické Pomoraví, Přírodní park Údolí Bystřice, Pstruží líheň Bělá, Ranšpurk, Rašeliniště Skřítek, Rohožnícky potok, Rudava, Rudavka (přítok Rudavy), Říka (přítok Olešnice), Salaška, Seznam léčivých pramenů v Luhačovicích, Siebertův vodní mlýn, Skalky u Hulína, Skařiny, Skřípovský mokřad, Smraďavka, Stibůrkovská jezera, Stojaspalův mlýn, Stolařka, Stonáč, Studánka Nad tratí, Studánka Pod Jedovou, Studánka U Kostelní cesty, Studená voda (přítok Lakšárského potoka), Sudoměřický potok (přítok Radějovky), Svodnice (přítok Moravy), Syrovinka, Telčava, Tlumačovská tůňka, Tovačovská jezera, Tovačovské rybníky, Trnovec (přírodní rezervace), Tršický vodopád, Tůň u Kostelan, Uhliska, Varhošťský potok, Vávrův mlýn (Vlkoš), Vavřincův kanál, Viničný kanál, Vlkoš – statek, Vodní elektrárna Strž, Vodní koridor Dunaj–Odra–Labe, Vodní nádrž Lučina (Radějovka), Vodní nádrž Ludkovice, Vodopád Na Strašidlech, Vracovský potok (přítok Syrovinky), Vypálenky, Vývrat (potok), Zámecký rybník Vizovice, Zástudánčí, Zaya, Zelený potok (přítok Moravy), Zohorský kanál,
Povodí Moravice
Moravice (řeka), Barokní most v Dolní Moravici, Černý potok (přítok Moravice), Hanzlův mlýn, Horský pramen, Hvozdnice (přírodní rezervace), Hvozdnice (přítok Moravice), Jelení studánka, Lučina (přítok Podolského potoka), Niva Moravice, Podolský potok (přítok Moravice), Pstruží potok (přírodní rezervace), Rašeliniště Skřítek, Růžová (přírodní rezervace), U Slatinného potoka, Vodní mlýn v Malé Štáhli, Vodní nádrž Kružberk, Vodní nádrž Slezská Harta, Weisshuhnův kanál,
Povodí Moravské Dyje
Moravská Dyje, Bílkovský mlýn, Bolíkovský potok, Černíč (přírodní památka), Illův mlýn, Koupaliště u Bohuslavic, Loucký mlýn, Luh u Telče, Moravská Dyje (přírodní památka), Myslůvka (potok), Nová Říše (přírodní památka), Olšina u Volfířova, Rašeliniště Radlice, Rašelinné jezírko Rosička, Řečický potok (přítok Volfířovského potoka), Řibřid, Šimkův mlýn, Šiškův mlýn, Šulákův mlýn, Vápovka, Vodní nádrž Nová Říše, Vodní pila (Penikov), Volfířovský potok,
Povodí Moravské Sázavy
Moravská Sázava, Březná (řeka), Dolní mlýn (Horní Heřmanice), Lukovský potok (přítok Moravské Sázavy), Poldr Žichlínek, Rychnovský potok (přítok Moravské Sázavy), Selský potok, U Kaštánku, V Dole,
Povodí Myjavy
Myjava (řeka), Baranský potok, Brestovský potok (přítok Myjavy), Brezovský potok (přítok Myjavy), Bystrina (přítok Brezovského potoka), Čierny potok (přítok Myjavské Rudavy), Dolinský potok (přítok Obradznovského potoka), Holubinka (potok), Myjavská Rudava, Priepasnianský potok, Štverník, Teplica (přítok Myjavy), Žriedlovský potok,
Povodí Odry
Odra, Povodí Odry, Povodí Odry (státní podnik), Barokní most (Martínkovice), Bařiny, Bažantula, Bielawka, Bulwary Nadodrzańskie, Čermenský mlýn, Čermná (přítok Plazskéko potoka), Čočkův mlýn, Děrné (vodní mlýn), Drexlerova pila, Dvorecký mlýn, Evropské rozvodí Bělotín, Hermesův mlýn, Heřmanický rybník (přírodní památka), Hraniční meandry Odry, Jez v Bartošovicích, Kališčok, Kamenný most (Město Libavá), Kamenný most se sochou svatého Jana Nepomuckého (Budišov nad Budišovkou), Královec (přírodní rezervace), Krasná studánka (Darkovice), Lesní studánka, Liduščiny studánky, Meandry Staré Odry, Mešnice (potok), Miedwie, Mlýnka, Mlýny ve Stachovicích, Morawa, Naučná stezka Kotvice, Naučná stezka u pramene Odry, Opusta (přítok Mešnice), Ostravské mlýny, Píšťský potok, Plazský mlýn, Plazský potok, Pohořský ledopád, Polanská niva, Polanský les, Polder Buków, Polder Racibórz Dolny, Pramen Odry, Pramen Židlo, Prameny U korýtka, Prameny Zrzávky, Priessnitzové koupele (Bělá), Propustek nedokončené železnice Děrné sever, Proskovický mlýn, Přemyšov, Přírodní koupaliště v Darkovicích, Pstruží farma Bělá, Rakovec (přítok Tichávky), Region Poodří, Rezavka, Rozhledna (Pogrzebień), Rozhledna Hraniční meandry Odry, Rybníky (přírodní rezervace), Rybníky v Trnávce, Rychtářský potok, Skučák, Smilovský potok, Smolenský potok (přítok Odry), Soutok Odry a Olše, Stará vodárna (Polančice), Studánka Pod Chmelníkem, Studánka svatého Jana, Studánka U Olší, Studánka U Tunelu, Studánka V Pekelném dole, Studnice (přítok Porubky), Šindelná pila, Troja (řeka), Václavův pramen (Stará Bělá), Vážská vodní cesta, Vlkovický mlýn, Vodní cesta Visla–Odra, Vodní koridor Dunaj–Odra–Labe, Vodní nádrž Pławniowice,
Povodí Olšavy
Bartkův mlýn, Horní louky, Chalupův mlýn, Jakubíkův mlýn, Kovářův žleb, Kozákův mlýn, Lávka Všezvěd, Luhačovická přehrada, Nivnička, Nové louky, Olšava, Olšava (přírodní památka), Pípalův mlýn, Rovná hora, Šťávnice, Terasy, Vlčnovský háj, Vrchové, Žilínský mlýn,
Povodí Ondřejnice
Ondřejnice, Hradní vrch Hukvaldy, Jarkovský potok, Palkovické hůrky (přírodní rezervace), Pod Hukvaldskou oborou, Vodní mlýn v Dolním Sklenově, Vodní nádrž Brušperk,
Povodí Oskavy
Oskava (řeka), Sitka (potok), Rabštejn (Hanušovická vrchovina), Rešovské vodopády, Rešovské vodopády (národní přírodní rezervace), Skalské rašeliniště, Sprchový potok,
Povodí Oslavy
Oslava, Balinka, Balinka (levý přítok Oslavy), Barokní most (Náměšť nad Oslavou), Bohdalovský potok, Bohdalovský rybník, Dědičná štola v Oslavanech, Divoká Oslava, Dobrá Voda (přírodní památka), Hodíškovský rybník (přírodní památka), Chvojnice, Kameňák (potok), Kundelovský potok, Laguna u Bohdalova, Mlýn v Novém Veselí, Most Vysočina, Mrázkova louka, Naučná stezka Balinské údolí, Olšoveček, Pohořílský potok, Přírodní park Oslava, Pyšelák, Rathan, Rychtářský rybník, Řihákův mlýn, Údolí Oslavy a Chvojnice, Vodní nádrž Mostiště,
Povodí Osoblahy
Osoblaha (řeka), Džungle (přírodní rezervace), Mušlov, Prudník (řeka), Svinný potok, Velký Pavlovický rybník,
Povodí Ostravice
Ostravice (řeka), Bílá Ostravice, Bučací potok (přírodní rezervace), Bučací vodopády, Byčinec, Čeladenka, Černá Ostravice, Harcovský most, Hradní lávka v Ostravě, Jez U Autokempu ve Frýdlantu, Lávka přes Ostravici z náměstí Jurije Gagarina v Ostravě, Magurka (potok), Maxova nádrž, Mořské oko (Horní Domaslavice), Most Miloše Sýkory v Ostravě, Naučná stezka hrabovského rodáka, básníka a spisovatele Viléma Závady v Hrabové, Novodvorský močál, Obidová (přírodní památka), Olešná (přítok Ostravice), Skaličník, Úpravna vody Nová Ves u Frýdlantu nad Ostravicí, Válcovenský jez ve Sviadnově a ve Frýdku-Místku, V Podolánkách, Vodní nádrž Baška, Vodní nádrž Olešná, Vodopády Satiny, Žermanický lom,
Povodí Ponávky
Ponávka, Babí doly, Soběšické rybníčky,
Povodí Punkvy
Punkva, Bílá voda (zdrojnice Punkvy), Černá skála (přírodní památka, okres Blansko), Dolní macošské jezírko, Horní macošské jezírko, Huťský potok (přítok Luhy), Krasovský potok, Křtinský lom, Lopač, Louky pod Skalami, Luha, Návesní niva, Nebeský rybník (přírodní památka), Nivské louky, Skalní mlýn, Skelná Huť (přírodní rezervace), Sloupský potok (zdrojnice Punkvy), Stará Rasovna, Suchý potok (přítok Němčického potoka), Vývěry Punkvy, Žďárná (potok),
Povodí Rokytné
Rokytná (řeka), Alinkov, Bolíkovický rybník (rybník Tkaný), Boříkovský potok, Dašovský mlýn, Dašovský potok, Drápalův mlýn, Jakubovka, Jedlový les a údolí Rokytné, Justinka, Knížecí seč, Krumlovsko-rokytenské slepence, Nový u háje, Ostrý potok (přítok Štěpánovického potoka), Přírodní park Rokytná, Račický potok (přítok Rouchovanky), Rokytka (přítok Rokytné), Rouchovanka, Římovka, Šebkovický potok, Šingrot, Štěpánovický potok (přítok Rokytné), Valův mlýn, Vranínský potok, Výrova skála,
Povodí Svitavy
Svitava, Bělá (přítok Svitavy), Křetínka, Ponávka, Punkva, Babolský háj, Býkovka, Cacovický mlýn, Cacovický náhon, Cacovický ostrov, Časnýř, Fritzův mlýn (Zářečí), Hamerský mlýn (Kanice), Louky pod Kulíškem, Melatín, Mokřad pod Tipečkem, Pirochtův mlýn, Porčův mlýn, Pražský viadukt, Radiměřský potok, Rudické propadání, Semíč, Sportovní ostrov Ludvíka Daňka, Studený potok (přítok Svitavy), Svitavský náhon, Tenorův mlýn, Úmoří (přítok Svitavy), Vídeňský viadukt, Zatopený lom v Blansku, Železniční viadukt v Obřanech,
Povodí Svratky
Povodí Svratky, Svratka, Bílý potok (pravý přítok Svratky), Bobrava, Fryšávka, Hodonínka, Jihlava (řeka), Litava (přítok Svratky), Loučka (přítok Svratky), Svitava, Tresenský potok, Besének, Brněnská přehrada, Bučkův mlýn, Bystřice (přítok Svratky), Černá studně, Černovický hájek, Damašek (přírodní rezervace), Dolní mušovský luh, Dřevěná lávka (Prudká), Dřevěný most (Černvír), Dřevěný most (Pernštejn), Fixův mlýn, Hamr Brušovec, Helenčina studánka, Hersica, Holásecká jezera, Ivanovický potok, Jakelský rybník, Jarošův mlýn, Javorův kopec (přírodní památka), Jimramovské mlýny, Knížecí les, Kohoutovický potok, Komínský potok, Kupcův mlýn a pila, Kuřimka, Leskava, Lísecký potok (přítok Bystřice), Louky u Polomu, Lubě (potok), Meandry Svratky u Milov, Milovský rybník, Mlýn Chlébské, Modřecký rybník, Nedvědička, Nosislavská zátočina, Nový rybník (Pomezí), Pilský rybníček, Pitrův most, Plácky (přírodní památka), Plačkův les a říčka Šatava, Ploník (přírodní rezervace), Pomezský rybník, Pramen u Svaté, Přehrady u Poličky, Přírodní park Bobrava, Přísnotický les, Rájecká tůň, Riviéra (Brno), Smrčecký potok, Soutok Svratky a Fryšávky, Svratecká vodohospodářská naučná stezka, Svitavský náhon, Svratecký náhon, Svratka (přírodní památka), Synský rybník, Šafranice (přírodní památka), Šildrův mlýn, Telecký mlýn, Troubný rybník, U Ruské boudy, Údolí Kohoutovického potoka, Veverka (potok), Vídeňský viadukt, Vodní elektrárna Kníničky, Vodní elektrárna Komín, Vodní kaple Jana Nepomuckého, Vodní mlýn (Doubravník), Vodní mlýn s pilou a olejnou, Vodní nádrž Vír I, Vodní nádrž Vír II, Vrbovec (potok), Zámecký mlýn (Velké Němčice), Záskalský potok, Žebětínský rybník, Židlochovický most,
Povodí Šlapanky
Šlapanka, Měšínský potok, Mlýnský potok (přítok Zlatého potoka), Ochozský potok (přítok Šlapanky), Peklo (rybník v Polné), Šlapanka (přírodní památka), Zhořský potok (přítok Šlapanky), Zlatý potok (přítok Šlapanky), Ždírecký potok,
Povodí Trkmanky
Trkmanka, Čejčské jezero, Haraska, Jesličky (přírodní památka), Kobylské jezero, Louky pod Kumstátem, Němčický potok (přítok Trkmanky), Nosperk, Spálený potok (přítok Trkmanky), Trkmanec-Rybníčky, Zázmoníky, Zimarky,
Povodí Třebůvky
Třebůvka, Dlouholoučské stráně, Durana (přírodní rezervace), Hradisko (přírodní památka), Jevíčka, Pod Skálou, Průchodnice, Rezavý potok, Rodlen, Rohová, Rudka (přírodní rezervace), Špraněk, Taramka, U nádrže, Uhřický potok,
Povodí Třešťského potoka
Třešťský potok, Bukovské rybníčky, Doupský a Bažantka, Jezdovické rašeliniště, Jezdovický rybník, Salavický mlýn, Váňovský rybník, Velký Pařezitý rybník, Vodní mlýn Janov,
Povodí Valové
Romže, Valová, Hloučela, Lešanský potok (přítok Romže), Smržický mlýn s olejnou, Ševčíkův mlýn, Toufarův mlýn, Vodní nádrž Plumlov, Vřesůvka,
Povodí Veličky
Velička (přítok Moravy), Baťův kanál, Panský mlýn (Velká nad Veličkou), Podhajský mlýn (Suchov),
Povodí Vsetínské Bečvy
Vsetínská Bečva, Bystřička (přítok Vsetínské Bečvy), Cábské jezero, Dobrodějka (Javorníky), Hořanský potok, Jasenice (potok), Jasenka (potok), Kychová (potok), Lúčky – Roveňky, Lušová (potok), Mikulův mlýn, Mokřady Vesník, Pulčínský vodopád, Ratibořka, Rokytenka (přítok Vsetínské Bečvy), Rybářské revíry Vsetínské Bečvy, Rybník Neratov, Semetínský potok, Senice (přítok Vsetínské Bečvy), Vodní dílo Karolinka, Vodní nádrž Bystřička, Zděchovka (potok),
Povodí Želetavky
Želetavka, Blatnice (přítok Želetavky), Kysibl (přírodní památka)