Území kraje je vymezeno územími okresů Zlín, Vsetín, Kroměříž a Uherské Hradiště.
K 1. lednu 2003 zanikly okresní úřady a území samosprávných krajů se od té doby pro účely státní správy dělí na správní obvody obcí s rozšířenou působností, ty pak dále na správní obvody obcí s pověřeným obecním úřadem. Kromě bývalých okresních měst vykonávají rozšířenou státní správu na území kraje ještě tyto obce: Bystřice pod Hostýnem, Holešov, Luhačovice, Otrokovice, Rožnov pod Radhoštěm, Uherský Brod, Valašské Klobouky, Valašské Meziříčí, Vizovice.
V kraji se nalézá 307 obcí, z toho 13 obcí s rozšířenou působností. 30 obcí má status města. Sídelním městem kraje je statutární město Zlín.
Okres Kroměříž (Morava): KM, počet obyvatel k 1. lednu 2020): 105 343, rozloha: 796, hustota zalidnění: 132 obyvatel na km², počet obcí: 79
Okres Uherské Hradiště (Morava): UH, počet obyvatel k 1. lednu 2020): 142 226, rozloha: 991, hustota zalidnění: 144 obyvatel na km², počet obcí: 78
Okres Vsetín (Morava): VS, počet obyvatel k 1. lednu 2020): 143 334, rozloha: 1 131, hustota zalidnění: 125 obyvatel na km², počet obcí: 59
Okres Zlín (Morava): ZL: počet obyvatel k 1. lednu 2020): 191 652, rozloha: 1 045, hustota zalidnění: 185 obyvatel na km², počet obcí: 91
Města a obce
V současnosti (2021) se ve Zlínském kraji nachází 30 měst, 6 městysů a 307 obcí.